Centrum Operacyjne powstało na bazie dotychczas działającego Ośrodka Ratownictwa, przejmując jego dotychczasowe obowiązki, ale też rozszerzając zakres działania. Głównym zadaniem nowej jednostki będzie całodobowa koordynacja działań wspierających bieżące funkcjonowanie Portu Gdańsk oraz jego eksploatację, ze szczególnym uwzględnieniem zapewnienia ciągłości i bezpieczeństwa operacyjnego.